5月5日下午4点35分左右，京都站内发生的水上物处理作业导致JR西日本列车运行受到很大影响。据JR西日本称，共有80趟列车停运，约8.5万人受到影响。

此次事件导致经过京都站的大阪方向和神户方向的JR线大部分完全停运或延误。停运和延误路段以及受影响线路如下：

- 大阪方向 - 京都线：全线完全停运 - 嵯峨野线：全线完全停运 - 琵琶湖线：全线完全停运 - 山阳线：1条线路完全停运，多条线路延误 - 九州线：全线完全停运

- 神户方向 - 神户线：1条线路完全停运，多条线路延误 - 福知山线：1条线路完全停运，多条线路延误 - 新干线：多条线路延误

此外，阪急、阪神、京阪、南海、近铁等在京都运营的私铁线路也多在京都站附近路段完全停运或延误。

JR西日本方面解释称，水上物处理作业完成后，恢复了正常运行状态。但由于此次事件的影响很大，因此表示将采取措施防止此类情况再次发生。

另一方面，据悉现场采取了周边道路管制和进出限制等措施，但并未出现混乱。一些网民猜测，可能是火车站设施使用者疏忽造成的物品遗留导致了此次事件，但具体原因尚不清楚。